MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 101098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018078	TGAA	2	8	226072	226079	50 %	25 %	25 %	0 %	392430608
5002	NC_018078	TCG	2	6	226108	226113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430608
5003	NC_018078	GTC	2	6	226137	226142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430608
5004	NC_018078	CGA	2	6	226148	226153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430608
5005	NC_018078	GAC	2	6	226164	226169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430608
5006	NC_018078	GCC	2	6	226246	226251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430608
5007	NC_018078	GCA	2	6	226271	226276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430608
5008	NC_018078	GGC	2	6	226332	226337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430608
5009	NC_018078	GGT	2	6	226375	226380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430608
5010	NC_018078	CGG	2	6	226406	226411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430608
5011	NC_018078	GGT	2	6	226458	226463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430608
5012	NC_018078	TGG	2	6	226830	226835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430609
5013	NC_018078	CTG	2	6	226872	226877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5014	NC_018078	GCG	2	6	226890	226895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430609
5015	NC_018078	GAC	2	6	226950	226955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5016	NC_018078	CGC	3	9	227006	227014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430609
5017	NC_018078	ACGT	2	8	227034	227041	25 %	25 %	25 %	25 %	392430609
5018	NC_018078	TAC	2	6	227049	227054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430609
5019	NC_018078	ACA	2	6	227132	227137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430609
5020	NC_018078	AGC	2	6	227148	227153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5021	NC_018078	CAC	2	6	227171	227176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430609
5022	NC_018078	CTA	2	6	227247	227252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430609
5023	NC_018078	GCT	2	6	227291	227296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5024	NC_018078	TGC	2	6	227302	227307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5025	NC_018078	GCC	2	6	227341	227346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430609
5026	NC_018078	GCT	2	6	227348	227353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5027	NC_018078	CCAC	2	8	227362	227369	25 %	0 %	0 %	75 %	392430609
5028	NC_018078	GTC	2	6	227403	227408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5029	NC_018078	GCG	2	6	227412	227417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430609
5030	NC_018078	GTC	2	6	227433	227438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5031	NC_018078	AGG	2	6	227452	227457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392430609
5032	NC_018078	CG	3	6	227490	227495	0 %	0 %	50 %	50 %	392430609
5033	NC_018078	TGC	2	6	227501	227506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5034	NC_018078	GCT	2	6	227546	227551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5035	NC_018078	CGG	2	6	227594	227599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430609
5036	NC_018078	ATGG	2	8	227600	227607	25 %	25 %	50 %	0 %	392430609
5037	NC_018078	GCA	2	6	227617	227622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430609
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5039	NC_018078	GCCT	2	8	227652	227659	0 %	25 %	25 %	50 %	392430609
5040	NC_018078	CGGC	2	8	227673	227680	0 %	0 %	50 %	50 %	392430609
5041	NC_018078	CAG	2	6	227712	227717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430609
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5043	NC_018078	GCCG	2	8	227758	227765	0 %	0 %	50 %	50 %	392430609
5044	NC_018078	CCGGG	2	10	227885	227894	0 %	0 %	60 %	40 %	392430609
5045	NC_018078	GGT	2	6	227906	227911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430609
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5050	NC_018078	CGG	2	6	228139	228144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430609
5051	NC_018078	GCG	2	6	228150	228155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430609
5052	NC_018078	GAG	2	6	228162	228167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392430609
5053	NC_018078	GC	3	6	228210	228215	0 %	0 %	50 %	50 %	392430609
5054	NC_018078	CGG	2	6	228230	228235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430609
5055	NC_018078	CAACGC	2	12	228237	228248	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	392430609
5056	NC_018078	GTT	2	6	228284	228289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430609
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5061	NC_018078	CGA	2	6	228470	228475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430609
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5063	NC_018078	GCA	2	6	228602	228607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430609
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5065	NC_018078	CGC	2	6	228663	228668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430609
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5069	NC_018078	CTG	2	6	228738	228743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5070	NC_018078	CGC	2	6	228783	228788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430609
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5112	NC_018078	GC	3	6	230937	230942	0 %	0 %	50 %	50 %	392430610
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5120	NC_018078	GCC	2	6	231191	231196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430610
5121	NC_018078	CCG	2	6	231254	231259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430610
5122	NC_018078	AC	3	6	231266	231271	50 %	0 %	0 %	50 %	392430610
5123	NC_018078	GCC	2	6	231277	231282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430610
5124	NC_018078	TGC	2	6	231308	231313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430610
5125	NC_018078	GCAC	2	8	231335	231342	25 %	0 %	25 %	50 %	392430610
5126	NC_018078	CGCA	2	8	231427	231434	25 %	0 %	25 %	50 %	392430610
5127	NC_018078	TGCGC	2	10	231447	231456	0 %	20 %	40 %	40 %	392430610
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5129	NC_018078	TGG	2	6	231606	231611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430611
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5135	NC_018078	GCT	2	6	231808	231813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430611
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5143	NC_018078	CGC	2	6	232098	232103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430611
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5221	NC_018078	AGT	2	6	235228	235233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430613
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5223	NC_018078	GCG	2	6	235306	235311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430613
5224	NC_018078	ATCCA	2	10	235314	235323	40 %	20 %	0 %	40 %	392430613
5225	NC_018078	GCTGAT	2	12	235328	235339	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392430613
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5227	NC_018078	CCA	2	6	235363	235368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430613
5228	NC_018078	CGG	2	6	235394	235399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430613
5229	NC_018078	CCA	2	6	235450	235455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430613
5230	NC_018078	GCT	2	6	235486	235491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430613
5231	NC_018078	CAC	2	6	235796	235801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430613
5232	NC_018078	CGA	2	6	235837	235842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430613
5233	NC_018078	CGG	2	6	235933	235938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430613
5234	NC_018078	GTA	2	6	235955	235960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430613
5235	NC_018078	TCG	2	6	235965	235970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430613
5236	NC_018078	GCC	3	9	236051	236059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430613
5237	NC_018078	GCG	2	6	236088	236093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430613
5238	NC_018078	TCG	2	6	236136	236141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430613
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5240	NC_018078	TCG	2	6	236178	236183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430613
5241	NC_018078	TGCGC	2	10	236209	236218	0 %	20 %	40 %	40 %	392430613
5242	NC_018078	GCA	2	6	236232	236237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430613
5243	NC_018078	TGGC	2	8	236244	236251	0 %	25 %	50 %	25 %	392430613
5244	NC_018078	GAT	2	6	236255	236260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430613
5245	NC_018078	GTCG	2	8	236312	236319	0 %	25 %	50 %	25 %	392430613
5246	NC_018078	CAGC	3	12	236344	236355	25 %	0 %	25 %	50 %	392430613
5247	NC_018078	GTC	2	6	236378	236383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430613
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5249	NC_018078	AAG	2	6	236523	236528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430614
5250	NC_018078	GAC	2	6	236537	236542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430614
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5253	NC_018078	ATC	2	6	236584	236589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430614
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5262	NC_018078	GGT	2	6	236869	236874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430614
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5347	NC_018078	GCCG	2	8	240180	240187	0 %	0 %	50 %	50 %	392430617
5348	NC_018078	GCC	2	6	240219	240224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430617
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5352	NC_018078	AGT	2	6	240484	240489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430617
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5355	NC_018078	TGA	2	6	240583	240588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430617
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5357	NC_018078	GCC	2	6	240717	240722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430617
5358	NC_018078	GC	3	6	240736	240741	0 %	0 %	50 %	50 %	392430617
5359	NC_018078	CCGGT	2	10	240887	240896	0 %	20 %	40 %	40 %	392430617
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5483	NC_018078	CTC	2	6	245941	245946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392430621
5484	NC_018078	CGG	2	6	245971	245976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430621
5485	NC_018078	ATG	3	9	246038	246046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430621
5486	NC_018078	GCG	2	6	246056	246061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430621
5487	NC_018078	TCA	2	6	246078	246083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430621
5488	NC_018078	GGC	2	6	246172	246177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430621
5489	NC_018078	AGC	2	6	246356	246361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430621
5490	NC_018078	CGACG	2	10	246373	246382	20 %	0 %	40 %	40 %	392430621
5491	NC_018078	CCG	2	6	246390	246395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430621
5492	NC_018078	CGG	2	6	246414	246419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430621
5493	NC_018078	AAC	2	6	246494	246499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430621
5494	NC_018078	ATG	2	6	246587	246592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430621
5495	NC_018078	GC	3	6	246597	246602	0 %	0 %	50 %	50 %	392430621
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5497	NC_018078	CGC	2	6	246651	246656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430621
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5499	NC_018078	ACC	2	6	246674	246679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430621
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